RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W HIS2P38635 335 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SPC72P39723 622 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data6.69□□□□□ -1.34not detected
LCB3YJL134W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ARH1P48360 493 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PSP2P50109 593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VPS62P53285 467 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YNL146WP53906 100 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YMR321CQ04898 105 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W APL5Q08951 932 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RAD1P06777 1100 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W EFT1P32324 842 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CDC11P32458 415 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SWI3P32591 825 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W GCG1P32656 232 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DBP7P36120 742 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MRX3P38172 270 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MGE1P38523 228 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YTA12P40341 825 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ASN1P49089 572 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SHE10P53075 577 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TPO2P53283 614 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RNT1Q02555 471 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ECI1Q05871 280 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RGA2Q06407 1009 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W OMS1Q06668 471 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SPO21Q12411 609 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W WHI5Q12416 295 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.68□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W QCR6P00127 147 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RGT1P32862 1170 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MUD2P36084 527 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VID24P38263 362 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SAP1P39955 897 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W FTR1P40088 404 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W QDR1P40475 563 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CPR7P47103 393 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W BRO1P48582 844 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ORC5P50874 479 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W BNI4P53858 892 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W EEB1Q02891 456 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NUT2Q06213 157 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W AIM41Q12032 185 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W HIF1Q12373 385 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TRM11Q12463 433 aa6.67□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YLR462WO13556 202 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NAT1P12945 854 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DAL2P25335 343 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VAC17P25591 423 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YUR1P26725 428 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DBF4P32325 704 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DPH2P32461 534 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RRT2P38332 387 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YHL049CP38722 271 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YEL075CP39972 122 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YER189WP40104 122 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RRN7P40992 514 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YFL064CP43540 174 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YGR111WP53265 400 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W GYL1Q04322 720 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.66□□□□□ -1.34not detected
LCB3YJL134W HFI1Q12060 488 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YBL111CQ3E7Y5 667 aa6.66□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RPS3P05750 240 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TIM23P32897 222 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SMY2P32909 740 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CSG2P35206 410 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SAK1P38990 1142 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W FIR1P40020 876 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MRS2Q01926 470 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TRS130Q03660 1102 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PPM1Q04081 328 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SHS1Q07657 551 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MET7Q08645 548 aa6.65□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VPS13Q07878 3144 aa6.65□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W MAS2P11914 482 aa6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W CDC42P19073 191 aa6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W COX11P19516 300 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W IME1P21190 360 aa6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W RME1P32338 300 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W MMS4P38257 691 aa6.64□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W TIF5P38431 405 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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