RNA–Protein interactions for RNA: YHR201C

PPX1, Transcript of Exopolyphosphatase, yeast

Gene PPX1, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPX1	YHR201C	SIC1	P38634	284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ALY2	P47029	1046 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	HXT16	P47185	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
PPX1	YHR201C	IML1	P47170	1584 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	TDP1	P38319	544 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	YBR259W	P38338	688 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	BCD1	P38772	366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	HOS4	P40480	1083 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	NSE3	Q05541	303 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	SGO1	Q08490	590 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	CDC43	P18898	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	FMP52	P40008	231 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	SUT2	Q12286	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
PPX1	YHR201C	KIN3	P22209	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	UBC11	P52492	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	TEL2	P53038	688 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	YBP2	P53169	641 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	SSL2	Q00578	843 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	GAD1	Q04792	585 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	VMR1	P38735	1592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	GDH3	P39708	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	NNF1	P47149	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	PEX2	P32800	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	PPZ2	P33329	710 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	HIR1	P32479	840 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	REV7	P38927	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	BAP3	P41815	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	TAH11	P47112	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPX1	YHR201C	ECM1	P39715	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YFL052W	P43551	465 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	PDR11	P40550	1411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MTC2	P34246	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YHR112C	P38716	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MTL1	P53214	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YAP1802	P53309	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MCD4	P36051	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YJL206C	P39529	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MAL11	P53048	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	NPY1	P53164	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ORC4	P54791	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	DMC1	P25453	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	SFB3	P38810	929 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	BNA2	P47125	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	SIR3	P06701	978 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	TIM23	P32897	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	APT2	P36973	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	FMO1	P38866	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	LYS9	P38999	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YIL166C	P40445	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	NDC80	P40460	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	CDC9	P04819	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	NUP60	P39705	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ENT1	Q12518	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	MCM21	Q06675	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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