RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W PHO81P17442 1178 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MIH1P23748 554 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W HXT7P39004 570 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W ACA1P39970 489 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W TAD1P53065 400 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YML131WQ03102 365 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W HOF1Q05080 669 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YLR040CQ07988 224 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W HFI1Q12060 488 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RRI2Q12348 645 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.62□□□□□ -1.83
RTT105YER104W DIF1O13577 133 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W DAL7P21826 554 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W DBF20P32328 564 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YKU70P32807 602 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MPE1P35728 441 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W KTR4P38131 464 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MAL31P38156 614 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W NPY1P53164 384 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MDG1P53885 366 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YHM2Q04013 314 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W OMS1Q06668 471 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W KCS1Q12494 1050 aa3.61□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MSS18P08593 268 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W APA1P16550 321 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W OAF3P36023 863 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SUL1P38359 859 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SET5P38890 526 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SHR5P41912 237 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W QRI7P43122 407 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W OPY2Q06810 360 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W LAS17Q12446 633 aa3.6□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YCL002CP25565 263 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SER1P33330 395 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W STE13P33894 931 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YKR018CP36114 725 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SAP190P36123 1033 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YKR051WP36142 418 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W CEP3P40969 608 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W YFL052WP43551 465 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W IES1P43579 692 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W BFA1P47113 574 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W HOL1P53389 586 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W MDM1Q01846 1127 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W TIM44Q01852 431 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W VPS30Q02948 557 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W SSP2Q08646 371 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W NPC2Q12408 173 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RTP1Q12751 981 aa3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RTT105YER104W PRC1P00729 532 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HOP1P20050 605 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MSM1P22438 575 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SEC65P29478 273 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PEX2P32800 271 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W IML2P47031 731 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BNA2P47125 453 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W NCS6P53088 359 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HDA1P53973 706 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YKR011CQ02209 353 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ENB1Q08299 606 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W THI21Q08975 551 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YOL114CQ12322 202 aa3.58□□□□□ -1.84
RTT105YER104W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.58□□□□□ -1.84not detected
RTT105YER104W SWI6P09959 803 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MDM10P18409 493 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W RPD3P32561 433 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TMT1P32643 299 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W JNM1P36224 373 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BUL1P48524 976 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PCL10P53124 433 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W GTR1Q00582 310 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TRS130Q03660 1102 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HLR1Q04429 423 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CRR1Q05790 422 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BLS1Q06071 122 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W DCS2Q12123 353 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms