RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W VPS21P36017 210 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W AIM10P39965 576 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MRX1P40050 688 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CTH1P47976 325 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MRM2P53123 320 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HER2Q03557 464 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YLR177WQ06251 628 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SGO1Q08490 590 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W REX3Q12090 404 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W REC8Q12188 680 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RAP1P11938 827 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W GCN3P14741 305 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CUE2P36075 443 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TED1P40533 473 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TOM22P49334 152 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ATF2P53296 535 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W UIP4Q08926 304 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W THP3Q12049 470 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HAP1P0CE41 1502 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PIF1P07271 859 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CKI1P20485 582 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W STV1P37296 890 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DED81P38707 554 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TRS85P46944 698 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SAE2P46946 345 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MAL11P53048 616 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ARC35P53731 342 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MEC3Q02574 474 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W FCP1Q03254 732 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPO20Q04359 397 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HRQ1Q05549 1077 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YPD1Q07688 167 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.35□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W YPR204WQ08995 1032 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ADF1Q2V2Q1 113 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LAM4P38800 1345 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W GPA2P10823 449 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MSD1P15179 658 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SRO9P25567 434 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TDP1P38319 544 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W JEM1P40358 645 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HYR1P40581 163 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MDJ2P42834 146 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W FAR7P43592 221 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YJL049WP47048 450 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YJR054WP47114 497 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W VIK1Q12045 647 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TIP41Q12199 356 aa5.35□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NTE1Q04958 1679 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data5.34□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W RGP1P16664 663 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NIP1P32497 812 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W APM3P38153 483 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YMR262WP38430 313 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SMF2P38778 549 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ERP5P38819 212 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YHR131CP38835 850 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CCT4P39078 528 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W VPS8P39702 1274 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RTS2P40962 232 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LYS14P40971 790 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W BNA3P47039 444 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MAD3P47074 515 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YJR079WP47126 109 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PCL10P53124 433 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YNL146WP53906 100 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ORC4P54791 529 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SRL4Q03085 281 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YDR090CQ03193 310 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ARP10Q04549 284 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W GAD1Q04792 585 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YLR125WQ12138 136 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YOS9Q99220 542 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data5.34□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RAD4P14736 754 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RVS161P25343 265 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CBF2P32504 956 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YBL010CP32788 280 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PPQ1P32945 549 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PMT1P33775 817 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YKT6P36015 200 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W BCH2P36122 765 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PEX32P38292 413 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W UTP9P38882 575 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ABM1P47146 123 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NIT3P49954 291 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1636.9 ms