RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP4	YPR178W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	YDL206W	Q12424	762 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RTP1	Q12751	981 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	CBF2	P32504	956 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RRN6	P32786	894 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SEG2	P34250	1132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	CDC27	P38042	758 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	PFF1	P38244	976 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	AAD16	Q02895	342 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	INP2	Q03824	705 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	PPM1	Q04081	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ERV41	Q04651	352 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.81	□□□□□ -0.68	not detected
PRP4	YPR178W	RKM4	Q12504	494 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TYR1	P20049	452 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	KAR4	P25583	335 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TOS1	P38288	455 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ASG1	P40467	964 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	YDR222W	Q04925	415 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	DON1	Q05610	365 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ECM4	P36156	370 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SET4	P42948	560 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SUM1	P46676	1062 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	FMS1	P50264	508 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	DIP5	P53388	608 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	UBX4	P54730	416 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ERO1	Q03103	563 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	FMN1	Q03778	218 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	MSH6	Q03834	1242 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ARO80	Q04052	950 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	UFO1	Q04511	668 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RUP1	Q12242	671 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TRM11	Q12463	433 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ARP6	Q12509	438 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	VPH2	P32341	215 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	CST26	P38226	397 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TAF3	Q12297	353 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RRD2	Q12461	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	FLO11	P08640	1367 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	YKU70	P32807	602 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	UBP15	P50101	1230 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	MIG2	P53035	382 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	USE1	P53146	245 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	ARK1	P53974	638 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	SLP1	Q12232	587 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRP4	YPR178W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	KIN1	P13185	1064 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	EXO70	P19658	623 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	MRM1	P25270	412 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	HEM3	P28789	327 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	YSC83	P32792	385 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	LHS1	P36016	881 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	YBP1	P38315	674 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	NDT80	P38830	627 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	PRK1	P40494	810 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	FMP33	P46998	180 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	CLA4	P48562	842 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	YML6	P51998	286 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	ATG17	Q06410	417 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	SLX4	Q12098	748 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	URA4	P20051	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	AEP2	P22136	580 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	MGT1	P26188	188 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	SUV3	P32580	737 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	SEC6	P32844	805 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	DUG2	P38149	878 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PRP4	YPR178W	STN1	P38960	494 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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