RNA–Protein interactions for RNA: YOL084W

PHM7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene PHM7, Length 2,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHM7	YOL084W	VPS75	P53853	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SKY1	Q03656	742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CDC42	P19073	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CDC11	P32458	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	VFA1	P40080	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MCM16	Q12262	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	IME1	P21190	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MSH3	P25336	1018 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	PRR1	P28708	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SLD2	P34252	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MIC60	P36112	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MSC7	P38694	644 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	OPT1	P40897	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	STR2	P47164	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	ALT2	P52892	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
PHM7	YOL084W	PPM1	Q04081	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	AGE1	Q04412	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	TUP1	P16649	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SWI3	P32591	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CSE2	P33308	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	YHR054C	P38780	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	JHD1	P40034	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	TAD1	P53065	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	PDR1	P12383	1068 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	KIP1	P28742	1111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	MCM2	P29469	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	RTT107	P38850	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CPR7	P47103	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	ESBP6	P53918	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	EEB1	Q02891	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	EAR1	Q03212	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	ISF1	P32488	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	HEL1	P36113	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	PLP2	Q12017	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	HMI1	Q12039	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	CTF3	Q12748	733 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHM7	YOL084W	SEC2	P17065	759 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	XRS2	P33301	854 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	MRPL7	P36519	292 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	BUD16	P39988	312 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TBF1	Q02457	562 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	SPP1	Q03012	353 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	AHC1	Q12433	566 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	RRT12	P25381	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	YHR202W	P38887	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	ZAP1	P47043	880 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	UME1	Q03010	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	CDD1	Q06549	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	SMC3	P47037	1230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	STB4	P50104	949 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	ECM3	Q99252	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TAO3	P40468	2376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	ADK2	P26364	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	NIP100	P33420	868 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	YFL052W	P43551	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	IES1	P43579	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHM7	YOL084W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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