RNA–Protein interactions for RNA: YNL050C

YNL050C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL050C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL050C	YNL050C	MCM21	Q06675	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	MCD4	P36051	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	BCD1	P38772	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	HOS4	P40480	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	YFL052W	P43551	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	UBC11	P52492	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	MAL11	P53048	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	COG8	Q04632	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	TIM23	P32897	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YNL050C	YNL050C	BUD6	P41697	788 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	UGO1	Q03327	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	IRC13	Q08630	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL050C	YNL050C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	DMC1	P25453	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YEL1	P34225	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	PCL5	P38794	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	SIR3	P06701	978 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	CIT2	P08679	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	HSL7	P38274	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ATF1	P40353	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NUP82	P40368	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NPY1	P53164	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNL050C	YNL050C	PHO8	P11491	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	REC102	Q02721	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NHX1	Q04121	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	KIN3	P22209	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	MSH2	P25847	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	HOG1	P32485	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YKR018C	P36114	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	DSS1	P39112	969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ASM4	Q05166	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	SRD1	P09007	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	HIR1	P32479	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	ARG2	P40360	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YIL166C	P40445	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	VBA3	P25594	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NUP60	P39705	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	GID8	P40208	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	PCL10	P53124	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	THI4	P32318	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	PEX6	P33760	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YHR112C	P38716	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	NDC80	P40460	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YML122C	Q03207	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	TAF3	Q12297	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL050C	YNL050C	YTA7	P40340	1379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	RPN13	O13563	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	TDP1	P38319	544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	FMO1	P38866	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	BDH2	P39713	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	MEF1	P25039	761 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	YKR051W	P36142	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	YJL206C	P39529	758 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	MTL1	P53214	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	FHN1	P53279	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	TAH11	P47112	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	CTR1	P49573	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	ATG4	P53867	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PEX1	P24004	1043 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	GLG1	P36143	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	LYS9	P38999	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms