RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W APE3P37302 537 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MED8P38304 223 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W VPS53P47061 822 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SNZ1Q03148 297 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W VPS60Q03390 229 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W DON1Q05610 365 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W HOM3P10869 527 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W CHS2P14180 963 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MRPL25P23369 157 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SMC1P32908 1225 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W OTU2P38747 307 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W BUD16P39988 312 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YEL025CP39991 1188 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YTA6P40328 754 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data5□□□□□ -1.61not detected
YMR196WYMR196W MSH6Q03834 1242 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SMC5Q08204 1093 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W DAS2Q12084 232 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YRM1Q12340 786 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W HNM1P19807 563 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data5□□□□□ -1.61not detected
YMR196WYMR196W KIN82P25341 720 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ACP1P32463 125 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TCD1P38756 429 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RTT102P53330 157 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RNH1Q04740 348 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SVF1Q05515 481 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W GPI13Q07830 1017 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W IES4Q08561 116 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TRM11Q12463 433 aa5□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W PUP2P32379 260 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MUD1P32605 298 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MRE11P32829 692 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W NDC80P40460 691 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SPR3P41901 512 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ESBP6P53918 673 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SLX4Q12098 748 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TY3A-GQ12173 290 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W WHI5Q12416 295 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YDL206WQ12424 762 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TY3A-IQ99219 290 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W CKI1P20485 582 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W DPB3P27344 201 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RAD54P32863 898 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W EXO84P38261 753 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W REI1P38344 393 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SMF1P38925 575 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W IRR1P40541 1150 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W COS5P47187 383 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W OPY2Q06810 360 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MPC54Q08550 464 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ERG11P10614 530 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W HIR2P32480 875 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RGT1P32862 1170 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W JNM1P36224 373 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W KIC1P38692 1080 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W APE4P38821 490 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W VPS41P38959 992 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MDR1P53258 950 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MAL13P53338 473 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YNL146WP53906 100 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W FAR1P21268 830 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W KIP1P28742 1111 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W PAP1P29468 568 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RME1P32338 300 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W IRE1P32361 1115 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SRB4P32569 687 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W VPS35P34110 944 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W FLR1P38124 548 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W EAF5P39995 279 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W RTT105P40063 208 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W VPS70P47161 811 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ALG12P53730 551 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YEL043WP32618 956 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ECM1P39715 212 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W DOT6P40059 670 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W HXT8P40886 569 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W ORC5P50874 479 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W HOP2P53187 214 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W MDM38Q08179 573 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W LAA1P39526 2014 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W AAD3P25612 363 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W SWD1P39706 426 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W NPP2P39997 493 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W IAH1P41734 238 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W YGR021WP53212 290 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR196WYMR196W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.7 ms