RNA–Protein interactions for RNA: YKL093W

MBR1, Transcript of Protein involved in mitochondrial functions and stress response, yeast

Gene MBR1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MBR1	YKL093W	MRP8	P35719	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	SDP1	P40479	209 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	UBA2	P52488	636 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	PFF1	P38244	976 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	PBY1	P38254	753 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	CTF8	P38877	133 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	MAD1	P40957	749 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	YML122C	Q03207	126 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	YPR196W	Q06595	470 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	CTI6	Q08923	506 aa		5	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	YIL089W	P40500	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	STB4	P50104	949 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	RNT1	Q02555	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	STE5	P32917	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	SHC1	P39000	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	IRR1	P40541	1150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	CWC24	P53769	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	MCH5	Q08777	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	ACF2	Q12168	779 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	ADE8	P04161	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	ALG7	P07286	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	PRI2	P20457	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	CTF13	P35203	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	IRC10	Q08118	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MBR1	YKL093W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	MAL31	P38156	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	HDA1	P53973	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	MUK1	Q02866	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	RPD3	P32561	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YKU70	P32807	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YRO2	P38079	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PFD1	P46988	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YBP2	P53169	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	ERO1	Q03103	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PEX19	Q07418	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	TRM11	Q12463	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	TOK1	P40310	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	STU2	P46675	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	LCD1	Q04377	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	FIG2	P25653	1609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	TPO2	P53283	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	VPS30	Q02948	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	MTH1	P35198	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PEA2	P40091	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	TIM44	Q01852	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PMD1	P32634	1753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	VAC8	P39968	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	ATF1	P40353	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MBR1	YKL093W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	IRC3	Q06683	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	FMP25	Q08023	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	FRE5	Q08908	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MBR1	YKL093W	MSM1	P22438	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	REC104	P33323	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	YBR184W	P38299	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	YHR078W	P38799	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	ELO3	P40319	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	SDS3	P40505	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	TIM50	Q02776	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	ADY4	Q05955	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
MBR1	YKL093W	SWM1	Q12379	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	GRX6	Q12438	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	MRPS35	P53292	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	ASI2	P53895	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	DLT1	Q04216	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	BDF2	Q07442	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	NUP145	P49687	1317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	MET3	P08536	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBR1	YKL093W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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