RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W NFU1P32860 256 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W CIN4P39110 191 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W AIM21P40563 679 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W AVT1P47082 602 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W KAP114P53067 1004 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W JJJ1P53863 590 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W PUN1Q06991 263 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W NCR1Q12200 1170 aa6.73□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-DR4O74302 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W CDC8P00572 216 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-AP0CX57 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W KIP1P28742 1111 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W COT1P32798 439 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YKL050CP35736 922 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TVP38P36164 337 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YEL025CP39991 1188 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YFL040WP43562 540 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-JR2P47099 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W CLA4P48562 842 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W KXD1P53158 218 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W BTN2P53286 410 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.72□□□□□ -1.33not detected
LCB3YJL134W ULP1Q02724 621 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W ROD1Q02805 837 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-DR1Q03856 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YMR018WQ04364 514 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YDL129WQ07555 291 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W GPI13Q07830 1017 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W SIL1Q08199 421 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-BRQ12217 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W TY1A-GR2Q12485 440 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W YKL068W-AQ3E826 78 aa6.72□□□□□ -1.33
LCB3YJL134W SNF1P06782 633 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CDC33P07260 213 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VAN1P23642 535 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SEC21P32074 935 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TFC4P33339 1025 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W IXR1P33417 597 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.71□□□□□ -1.34not detected
LCB3YJL134W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TDA3P38758 523 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W EAF5P39995 279 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NPP2P39997 493 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PSY2P40164 858 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ACF4P47129 309 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ENV11P53246 860 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MDR1P53258 950 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RTT102P53330 157 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VTC3Q02725 835 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W FMP30Q02883 468 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W VTI1Q04338 217 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DUS4Q06063 367 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ICL2Q12031 575 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W NUR1Q12066 484 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SLX4Q12098 748 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W YLL058WQ12198 575 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W OSW2Q12202 724 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ZRT2Q12436 422 aa6.71□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DED1P06634 604 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ERG11P10614 530 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W SEC2P17065 759 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W IRE1P32361 1115 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W BLI1P35727 113 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RCK2P38623 610 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W BOL3P39724 118 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MXR1P40029 184 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W MIC19P43594 170 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RPC17P47076 161 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W HSH155P49955 971 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CUL3P53202 744 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W URH1Q04179 340 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W COQ9Q05779 260 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W ECM30Q06673 1274 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W IES4Q08561 116 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W LDB19Q12502 818 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W RMP1Q12530 201 aa6.7□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W CBF2P32504 956 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W LDH1P38139 375 aa6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W OLA1P38219 394 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LCB3YJL134W EXO5P38289 585 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.2 ms