RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TOD6	P34219	525 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	HXT7	P39004	570 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SWM1	Q12379	170 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	KAR4	P25583	335 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	DAL3	P32459	195 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	LST4	P34239	828 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SIC1	P38634	284 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	YJR039W	P47107	1121 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	YLR415C	O13578	112 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	ELM1	P32801	640 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	NIT2	P47016	307 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	EXG2	P52911	562 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PKH1	Q03407	766 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	LAS17	Q12446	633 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.43	□□□□□ -1.54	not detected
RPC17	YJL011C	THI80	P35202	319 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PEX8	P53248	589 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	MRPS35	P53292	345 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PEX19	Q07418	342 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	TFC4	P33339	1025 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	OAF3	P36023	863 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PEX14	P53112	341 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	ORC4	P54791	529 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	YHM2	Q04013	314 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	HFI1	Q12060	488 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	APM4	Q99186	491 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	AEP2	P22136	580 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PLC1	P32383	869 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	DID4	P36108	232 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	GRX7	P38068	203 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	FAT1	P38225	669 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	RPP1	P38786	293 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	BEM4	P39011	633 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	ATG36	P46983	293 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	TRM11	Q12463	433 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	RMP1	Q12530	201 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SWI6	P09959	803 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	STE11	P23561	717 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	CTF13	P35203	478 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	MAL31	P38156	614 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	GID8	P40208	455 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	ERG5	P54781	538 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	NRG1	Q03125	231 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPC17	YJL011C	SEC65	P29478	273 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	NGG1	P32494	702 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	APN2	P38207	520 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YBP2	P53169	641 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YNL034W	P53963	612 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YNL018C	P53976	612 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	TGL2	P54857	326 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	TGL5	Q12043	749 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YHR202W	P38887	602 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	BUL1	P48524	976 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	SND1	Q04007	877 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	ENB1	Q08299	606 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YLR358C	O13565	187 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YKU70	P32807	602 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YKR075C	P36155	307 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YBR259W	P38338	688 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YHR112C	P38716	378 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	ECM1	P39715	212 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	FKH2	P41813	862 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	SKY1	Q03656	742 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	MCM21	Q06675	368 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	YPR027C	Q12079	277 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	BIT2	P38346	545 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	BFA1	P47113	574 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPC17	YJL011C	CTS1	P29029	562 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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