RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W YJR142WP47173 342 aa5.06□□□□□ -1.6
SPT15YER148W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SPT15YER148W ZIP2P53061 704 aa5.06□□□□□ -1.6
SPT15YER148W YDR338CQ05497 695 aa5.06□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SEC21P32074 935 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SPT15YER148W DCG1P32460 244 aa5.05□□□□□ -1.6
SPT15YER148W FLR1P38124 548 aa5.05□□□□□ -1.6
SPT15YER148W TMA10Q06177 86 aa5.05□□□□□ -1.6
SPT15YER148W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SPT15YER148W TUB3P09734 445 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W RAD18P10862 487 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W MGS1P40151 587 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SSY5P47002 699 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W BNA2P47125 453 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W ASI2P53895 289 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W NHX1Q04121 633 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SSN2P38931 1420 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.04□□□□□ -1.6
SPT15YER148W ADR1P07248 1323 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SFL1P20134 766 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W MIH1P23748 554 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W KAR4P25583 335 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W HSL7P38274 827 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W PCM1P38628 557 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6 RIP-Chip
SPT15YER148W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W ATG33Q06485 197 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W ESC8Q08119 714 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SWM1Q12379 170 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W TRM3Q07527 1436 aa5.03□□□□□ -1.6
SPT15YER148W SPO14P36126 1683 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CTS1P29029 562 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PZF1P39933 429 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W GPR1Q12361 961 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TRM11Q12463 433 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SPP41P38904 1435 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SNT2P53127 1403 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W DOP1Q03921 1698 aa5.02□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W NGG1P32494 702 aa5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W MET13P53128 600 aa5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CRR1Q05790 422 aa5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PEX19Q07418 342 aa5.01□□□□□ -1.61
SPT15YER148W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TSC11P40061 1430 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W HMG1P12683 1054 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CTF13P35203 478 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CRP1P38845 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SAK1P38990 1142 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W MSS4P38994 779 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W VHR1P40522 640 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PFA3P42836 336 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YFL052WP43551 465 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PMT3P47190 753 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W HLJ1P48353 224 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W NPY1P53164 384 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SDA1P53313 767 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W GIN4Q12263 1142 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W LAS17Q12446 633 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YLR149CQ99296 730 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-ER2Q03619 1755 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-MR1Q04214 1755 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-NL1Q12112 1755 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-GR1Q12141 1755 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TY1B-BLQ12490 1755 aa5□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YLR415CO13578 112 aa4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CCR4P31384 837 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YKR018CP36114 725 aa4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SIC1P38634 284 aa4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W ERG5P54781 538 aa4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PKH1Q03407 766 aa4.99□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YKR051WP36142 418 aa4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W DOT6P40059 670 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W TAF1P46677 1066 aa4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W GUD1Q07729 489 aa4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W THI73Q07904 523 aa4.98□□□□□ -1.61
SPT15YER148W CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W HCM1P25364 564 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W YCR015CP25616 317 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W MIP6P38760 659 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W RPP1P38786 293 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W UBP12P39538 1254 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W ECM1P39715 212 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W BUL1P48524 976 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W AIM14P53109 570 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W PCL10P53124 433 aa4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SPT15YER148W NTO1Q12311 748 aa4.97□□□□□ -1.61
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