RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	NPP2	P39997	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	BNA2	P47125	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HFM1	P51979	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PUS2	P53167	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SFB2	P53953	876 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HFI1	Q12060	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PRC1	P00729	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PHO81	P17442	1178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YKR018C	P36114	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	CEP3	P40969	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	ECL1	P48235	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	EAR1	Q03212	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	VPS15	P22219	1454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HSF1	P10961	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SSH4	P32343	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HOL1	P53389	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YHM2	Q04013	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	MIH1	P23748	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	ADP1	P25371	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YKU70	P32807	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	ATG19	P35193	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	OAF3	P36023	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YKR075C	P36155	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HXT7	P39004	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	UBP5	P39944	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	ZIP2	P53061	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HDA1	P53973	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	RSM24	Q03976	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	CRR1	Q05790	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	TRE1	Q08919	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	THI21	Q08975	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YCL002C	P25565	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	APL1	P27351	700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YKL222C	P35995	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	YHL041W	P38730	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	HIS6	P40545	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SAP185	P40856	1058 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	PCL10	P53124	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	SIN3	P22579	1536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUS1	YDL193W	AIM26	P32858	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	YKR051W	P36142	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	FLR1	P38124	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	POA1	P38218	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	ACA1	P39970	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	TAF1	P46677	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
NUS1	YDL193W	MSC2	Q03455	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	SSY1	Q03770	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	COG4	Q06096	861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	SEC65	P29478	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	RPN12	P32496	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	SDS22	P36047	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	PEX7	P39108	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	YGR012W	P53206	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
NUS1	YDL193W	SWI6	P09959	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	HOP1	P20050	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	SAW1	P39735	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	MDG1	P53885	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUS1	YDL193W	XYL2	Q07993	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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