RNA–Protein interactions for RNA: YDL064W

UBC9, Transcript of SUMO-conjugating enzyme involved in the Smt3p conjugation pathway, yeast

Gene UBC9, Length 474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBC9	YDL064W	PKH1	Q03407	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	HFD1	Q04458	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	DCS2	Q12123	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	DAL3	P32459	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	CTF13	P35203	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	TAF1	P46677	1066 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	EUG1	P32474	517 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	TDA3	P38758	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	FKH2	P41813	862 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	FOL1	P53848	824 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	ECM9	Q02202	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	TRM13	Q12383	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	TRM11	Q12463	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBC9	YDL064W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	STE11	P23561	717 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	CTS1	P29029	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	DCG1	P32460	244 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	HXT7	P39004	570 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	RET2	P43621	546 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YGR153W	P48238	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	BUL1	P48524	976 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ORC4	P54791	529 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ENB1	Q08299	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	TGL5	Q12043	749 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	NRG1	Q03125	231 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	TOM20	P35180	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YHR112C	P38716	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	IRC24	P40580	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ESC8	Q08119	714 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	HCM1	P25364	564 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	NGG1	P32494	702 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	FAT1	P38225	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	SIC1	P38634	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YNL195C	P40168	261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YBP2	P53169	641 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	MAL31	P38156	614 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YBR071W	P38243	211 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YBR259W	P38338	688 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YHR202W	P38887	602 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	BEM4	P39011	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	MUP1	P50276	574 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	COG6	P53959	839 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YHM2	Q04013	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	SEC65	P29478	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	PAF1	P38351	445 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	GID8	P40208	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	HFI1	Q12060	488 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	NTO1	Q12311	748 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBC9	YDL064W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	OAF3	P36023	863 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	APN2	P38207	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	LYS9	P38999	446 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	GIP4	P39732	760 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	MTL1	P53214	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	SWI6	P09959	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	ERG4	P25340	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	MRC1	P25588	1096 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	YKU70	P32807	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	DID4	P36108	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	YBR053C	P38235	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	NIT2	P47016	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	COX18	P53239	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBC9	YDL064W	YPS7	Q06325	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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