RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRP1Q02821 542 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMA2Q04658 369 aa1.08□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKL033W-AQ86ZR7 236 aa1.08□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIR3P06701 978 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GCR1P07261 785 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE12P13574 688 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMC1P32331 307 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPD3P32561 433 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARC40P38328 384 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TSL1P38427 1098 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAA2P39518 744 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNT3P40549 630 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ASI2P53895 289 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HFD1Q04458 532 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG11Q12527 1178 aa1.07□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC3Q06683 689 aa1.06□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KCC4P25389 1037 aa1.05□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BEM3P32873 1128 aa1.05□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKR078WP36158 585 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 JHD1P40034 492 aa1.05□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD7Q08754 746 aa1.05□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC48P25694 835 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TYE7P33122 291 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data1.04□□□□□ -2.24not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GMH1P36125 273 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BAP3P41815 604 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL260WP53056 76 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG13P54839 491 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TGL5Q12043 749 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ULA1Q12059 462 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RKM4Q12504 494 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBL113CQ7M4S9 792 aa1.04□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR415CO13578 112 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUB1P25659 250 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKL107WP34251 309 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EXO84P38261 753 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SFB3P38810 929 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PZF1P39933 429 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL066WQ12194 479 aa1.03□□□□□ -2.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INO1P11986 533 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TSR4P25040 408 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC12P32468 407 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL169CP40442 995 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CEP3P40969 608 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT16P47185 567 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKE2P52553 114 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR122WP53272 402 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa1.02□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD2P07276 1031 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET4P32389 672 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LYP1P32487 611 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPT1P33299 467 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MOT2P34909 587 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR238CP38330 731 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CCT3P39077 534 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNF7P39929 240 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPC98P53540 846 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APJ1P53940 528 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKR011CQ02209 353 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRL1Q08673 210 aa1.01□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RFA1P22336 621 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMC2P38087 329 aa1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NMD5P46970 1048 aa1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FHN1P53279 174 aa1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATP23P53722 227 aa1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TMA46Q12000 345 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHO11P35842 467 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHO12P38693 467 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP7P40453 1071 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNO3P43544 222 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTT10Q08924 1013 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FRE7Q12333 620 aa0.99□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR089WO13585 888 aa0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUP1P16649 713 aa0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MVD1P32377 396 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ASN1P49089 572 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HDA1P53973 706 aa0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENT2Q05785 613 aa0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRS5Q12265 496 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRP2P00899 507 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MGM1P32266 881 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHL050CP38721 697 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FLO5P38894 1075 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR219WP38900 624 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAK1P38990 1142 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SKP2P42843 763 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL1Q04599 285 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTT103Q05543 409 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 USV1Q12132 391 aa0.97□□□□□ -2.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS9AO13516 197 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHO5P00635 467 aa0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIP2P52960 996 aa0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FCP1Q03254 732 aa0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAD1Q04792 585 aa0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DUS3Q06053 668 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUB2Q07478 446 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NRT1Q08485 598 aa0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81 ms