RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	KRE28	Q04431	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BDF2	Q07442	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	REC8	Q12188	680 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	FRT1	Q99332	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	EDE1	P34216	1381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	REC107	P21651	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MET4	P32389	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SSO1	P32867	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VPS35	P34110	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	HCS1	P34243	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	UGA2	P38067	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BAP2	P38084	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YIR014W	P40570	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SNZ3	P43545	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PPT1	P53043	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YGR067C	P53243	804 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MDR1	P53258	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SNZ2	P53824	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YML108W	Q03759	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	DON1	Q05610	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MCP2	Q06567	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MLH2	Q07980	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MRP10	O75012	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	STF1	P01098	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PIF1	P07271	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YIL166C	P40445	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YFL066C	P43538	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YJL055W	P47044	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	APS3	P47064	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ORM1	P53224	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CDC55	Q00362	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SND1	Q04007	877 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	THI72	Q08579	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	BUD7	Q08754	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RAD9	P14737	1309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	AFR1	P33304	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	STE13	P33894	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKL222C	P35995	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MSR1	P38714	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	PCL7	P40186	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SSN8	P47821	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ECL1	P48235	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	FDC1	Q03034	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	ACF2	Q12168	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CKA2	P19454	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VPS3	P23643	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VPH2	P32341	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SSH4	P32343	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	KAR9	P32526	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TFB1	P32776	642 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CNS1	P33313	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	DUR3	P33413	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MDJ1	P35191	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VAC8	P39968	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TOK1	P40310	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	URB2	P47108	1174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	UBA2	P52488	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SAP4	P53036	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MPS2	P53159	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	IPI3	P53877	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MRS2	Q01926	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MUB1	Q03162	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MED4	Q12343	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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