RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	ENV11	P53246	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SKY1	Q03656	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	TRE1	Q08919	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PRC1	P00729	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	AIM26	P32858	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YKL133C	P36066	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	EMP65	P40085	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YFL066C	P43538	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	BNA2	P47125	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SLD3	P53135	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	VPS30	Q02948	557 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YHM2	Q04013	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	TDA6	Q06466	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MLC2	Q06580	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TDA3	YHR009C	THI21	Q08975	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	HFI1	Q12060	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	APM4	Q99186	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	APL1	P27351	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RPD3	P32561	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MNN4	P36044	1178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RIM4	P38741	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YFL052W	P43551	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SPS1	P08458	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SRP101	P32916	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	OAF3	P36023	863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YKR018C	P36114	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PTC7	P38797	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	ZIP2	P53061	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MSC2	Q03455	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	DCS2	Q12123	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	NKP1	Q12493	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YKL222C	P35995	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	GTS1	P40956	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	CDA1	Q06702	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PEX15	Q08215	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	HSF1	P10961	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SEC65	P29478	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YKU70	P32807	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	FLR1	P38124	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MAL31	P38156	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	FAT1	P38225	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SAF1	P38352	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YHL041W	P38730	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	HIS6	P40545	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	FBP1	P09201	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PTH2	P34222	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PCL10	P53124	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YGR012W	P53206	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	RSM24	Q03976	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	KTR4	P38131	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	POA1	P38218	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TDA3	YHR009C	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ARP4	P80428	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SSY1	Q03770	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	NSI1	Q12457	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TDA3	YHR009C	MSS18	P08593	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SWI6	P09959	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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