RNA–Protein interactions for RNA: YGL017W

ATE1, Transcript of Arginyl-tRNA-protein transferase, yeast

Gene ATE1, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATE1	YGL017W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SEC65	P29478	273 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SRB4	P32569	687 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MET1	P36150	593 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	HXT5	P38695	592 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CTM1	P38818	585 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
ATE1	YGL017W	PES4	P39684	611 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	JJJ2	P46997	583 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YJR079W	P47126	109 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	GPI8	P49018	411 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	EST2	Q06163	884 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SFH1	Q06168	426 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	LAM4	P38800	1345 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CYB2	P00175	591 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MTF2	P10849	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RPB10	P22139	70 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YSW1	P38280	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SMF1	P38925	575 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	EFM4	P40516	257 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	TRS85	P46944	698 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	IRC4	Q03036	179 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ORM2	Q06144	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	DCS2	Q12123	353 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RAD3	P06839	778 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CMP2	P14747	604 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SAS3	P34218	831 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MAL31	P38156	614 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PET100	P38958	111 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SSN3	P39073	555 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MEP1	P40260	492 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YFH7	P43591	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	LYS5	P50113	272 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YNL193W	P53870	558 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YML119W	Q03208	357 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ATG26	Q06321	1198 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PCL8	Q08966	492 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	TAH18	Q12181	623 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RRI2	Q12348	645 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	NKP1	Q12493	238 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CKI1	P20485	582 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SPO11	P23179	398 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	NIP100	P33420	868 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YET1	P35723	206 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SPR3	P41901	512 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YGR117C	P53270	476 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SDH5	Q08230	162 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RMP1	Q12530	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
ATE1	YGL017W	FAR1	P21268	830 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	RAD53	P22216	821 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	MET4	P32389	672 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	HIR2	P32480	875 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	AFG2	P32794	780 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	COY1	P34237	679 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	RER2	P35196	286 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	HEL1	P36113	551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	BCD1	P38772	366 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	MAD1	P40957	749 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	ILM1	P47155	203 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	YGR237C	P50089	785 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	SHE4	P51534	789 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	MMR1	Q06324	491 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	GAS5	Q08193	484 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATE1	YGL017W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.71	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms