RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 PTPRCP08575 1304 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 TRAF5O00463 557 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 A0A087WZG4 1122 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 RGL2O15211 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 GRM1Q13255 1194 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 COPS6Q7L5N1 327 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 GPC2Q8N158 579 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ECE1P42892 770 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SCNN1DP51172 638 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SLC51AQ86UW1 340 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SETDB2Q96T68 719 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ST5P78524 1137 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 KSR2Q6VAB6 950 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 NUP98P52948 1817 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ABCC4O15439 1325 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 TRIM27P14373 513 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 MAP2K2P36507 400 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 EPS15P42566 896 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SYNE4Q8N205 404 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 NPR1P16066 1061 aa21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 DGKZQ13574 1117 aa21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.34■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.34■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.34■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.33■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 ZIC5Q96T25 663 aa21.33■■□□□ 1.01
PACS1-208ENST00000529677 MS4A1P11836 297 aa21.32■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 PDE3AQ14432 1141 aa21.32■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.32■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.32■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 PLIN1O60240 522 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 SOX10P56693 466 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 TNNQ9UQP3 1299 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.31■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 F6X3S4 739 aa21.3■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 CA12O43570 354 aa21.3■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.3■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 HLFQ16534 295 aa21.29■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.29■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 PSMD1Q99460 953 aa21.29■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 NPHP1O15259 732 aa21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 RLBP1P12271 317 aa21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 BEND3Q5T5X7 828 aa21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.28■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 TCIRG1Q13488 830 aa21.27■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 LINS1Q8NG48 757 aa21.27■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.27■■□□□ 1
PACS1-208ENST00000529677 ABCC12Q96J65 1359 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 IGKV5-2P06315 115 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 ALDH1L1O75891 902 aa21.25■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.25■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 PANK1Q8TE04 598 aa21.25■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.25■□□□□ 0.99
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