RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 USP46P62068 366 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SLIT3O75094 1523 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF10O15013 1369 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ATG7O95352 703 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 UQCRHP07919 91 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 POTEJP0CG39 1038 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 STK32AQ8WU08 396 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 KIF2CQ99661 725 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 LNPKQ9C0E8 428 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 LTN1O94822 1766 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 AMPHP49418 695 aa8.71□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.71□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 BRINP3Q76B58 766 aa8.71□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PXDNQ92626 1479 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 REC8O95072 547 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TNNQ9UQP3 1299 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 NFAT5O94916 1531 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PEAK1Q9H792 1746 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 UNCXA6NJT0 531 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 SSFA2P28290 1259 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 IL13P35225 146 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RIMBP2O15034 1052 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RIPK4P57078 832 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 UVSSAQ2YD98 709 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 MCTP1Q6DN14 999 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC6O95255 1503 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 GCP02774 474 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 FBLN1P23142 703 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PSEN2P49810 448 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 SLF2Q8IX21 1173 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ATP9BO43861 1147 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RNF40O75150 1001 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TPM3P06753 285 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 SCNN1AP37088 669 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 IP6K1Q92551 441 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC9P31274 260 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC4O15439 1325 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TOM1O60784 492 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 KIF20AO95235 890 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO45P0C2W1 286 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 GNAI1P63096 354 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TAF3Q5VWG9 929 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.66□□□□□ -1.02
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