RNA–Protein interactions for RNA: YOR112W

CEX1, Transcript of Component of nuclear aminoacylation-dependent tRNA export pathway, yeast

Gene CEX1, Length 2,286 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CEX1	YOR112W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	YGL081W	P53156	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	HSE1	P38753	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	NPP2	P39997	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEX1	YOR112W	TOK1	P40310	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SNF5	P18480	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	CDC11	P32458	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ALT1	P52893	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	GPG1	P53130	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	VBA3	P25594	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	PPH3	P32345	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	NNK1	P36003	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	GYP8	P43570	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	NCS6	P53088	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YNL193W	P53870	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	DPH6	Q12429	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	DOM34	P33309	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YRO2	P38079	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	CDC9	P04819	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YSC84	P32793	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	DSS1	P39112	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	MTC3	P53077	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	TPP1	Q03796	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ACM1	Q08981	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SIR4	P11978	1358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CEX1	YOR112W	RAD53	P22216	821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	PRO1	P32264	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ALG2	P43636	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	BUD9	P53226	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SFP1	P32432	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SPC29	P33419	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	BAP2	P38084	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	LCD1	Q04377	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	BI4	P03879	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ESL2	P36168	1195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SHC1	P39000	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	BOI2	P39969	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YFL066C	P43538	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YJR120W	P47157	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	FOL1	P53848	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	PFF1	P38244	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	GEM1	P39722	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	THI73	Q07904	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YIL089W	P40500	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	HLJ1	P48353	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YGR237C	P50089	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YGR035C	P53222	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	TPO2	P53283	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ADE8	P04161	214 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SRD1	P09007	221 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SAM35	P14693	329 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
CEX1	YOR112W	MAL31	P38156	614 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	GIC1	P38785	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	MDM38	Q08179	573 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	ENV7	Q12003	364 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEX1	YOR112W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	PCL2	P25693	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	MGS1	P40151	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	YNR014W	P53719	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	AI3	P03877	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	SFA1	P32771	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	MTC2	P34246	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	RTS3	P53289	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	TNA1	P53322	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	SFB2	P53953	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	RAD18	P10862	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	REC104	P33323	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	PRY1	P47032	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	YKE2	P52553	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	UME1	Q03010	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEX1	YOR112W	YVC1	Q12324	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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