RNA–Protein interactions for RNA: YNR063W

YNR063W, Transcript of Putative zinc-cluster protein of unknown function, yeast

Gene YNR063W, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR063W	YNR063W	YCR015C	P25616	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SWC3	P31376	625 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	ERT1	P38140	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	GNP1	P48813	663 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SWI1	P09547	1314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	LYS2	P07702	1392 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	DAL5	P15365	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SNF5	P18480	905 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RAD24	P32641	659 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	PFF1	P38244	976 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	FYV10	P40492	516 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	CNN1	P43618	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	HNT2	P49775	206 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SPR28	Q04921	423 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	GCR1	P07261	785 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RAD27	P26793	382 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	HXT13	P39924	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	HXT17	P53631	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	HXT15	P54854	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	DNM1	P54861	757 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RMD1	Q03441	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	PEP7	P32609	515 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	TOD6	P34219	525 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	FLR1	P38124	548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	ERO1	Q03103	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	CSI1	Q04368	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SGD1	Q06132	899 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	CDC45	Q08032	650 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	MLS1	P30952	554 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	YKU70	P32807	602 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	GIP4	P39732	760 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	GSM1	P42950	618 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	UBP16	Q02863	499 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RSM24	Q03976	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	GRX6	Q12438	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	YER152C	P10356	443 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RFC5	P38251	354 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	TAF1	P46677	1066 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	THI3	Q07471	609 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR063W	YNR063W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	MCM7	P38132	845 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	LAM1	P38851	1228 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	MPH1	P40562	993 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	GNT1	Q12096	491 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	YLR358C	O13565	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	MGM1	P32266	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	RER2	P35196	286 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	VPS4	P52917	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	STV1	P37296	890 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SHC1	P39000	512 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	UBP12	P39538	1254 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	YIL092W	P40497	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SPT20	P50875	604 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SPO1	P53541	631 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	GCN5	Q03330	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SVS1	Q12254	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
YNR063W	YNR063W	BAS1	P22035	811 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	MSM1	P22438	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	PET112	P33893	541 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	MEF2	P39677	819 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	YFL054C	P43549	646 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	SPL2	P38839	148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	HKR1	P41809	1802 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	CMP2	P14747	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	KRE2	P27809	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	LYP1	P32487	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	IRC4	Q03036	179 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR063W	YNR063W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms