RNA–Protein interactions for RNA: YMR123W

PKR1, Transcript of V-ATPase assembly factor, yeast

Gene PKR1, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PKR1	YMR123W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	KAR4	P25583	335 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	AIM21	P40563	679 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	HUL5	P53119	910 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	YGR125W	P53273	1036 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	HDA1	P53973	706 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	BDF2	Q07442	638 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	FLC1	Q08967	793 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	ENV7	Q12003	364 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	LAS17	Q12446	633 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	TOP3	P13099	656 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	CTF8	P38877	133 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	MSS4	P38994	779 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	SDP1	P40479	209 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	HUL4	P40985	892 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
PKR1	YMR123W	SUN4	P53616	420 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	NSE3	Q05541	303 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	PNS1	Q12412	539 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
PKR1	YMR123W	RPD3	P32561	433 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	EMC3	P36039	253 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	CHS7	P38843	316 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	BUL1	P48524	976 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PKR1	YMR123W	GAL11	P19659	1081 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	BET3	P36149	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CEP3	P40969	608 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	NIT3	P49954	291 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	KIN4	Q01919	800 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	GIS1	Q03833	894 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	AIM39	Q08223	395 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CAN1	P04817	590 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	GYP8	P43570	497 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	RTA1	P53047	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	SLI1	P53304	468 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CTF4	Q01454	927 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	KTR4	P38131	464 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YHR078W	P38799	552 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	ALG2	P43636	503 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	DAM1	P53267	343 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	ERG5	P54781	538 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	PPM2	Q08282	695 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	DAL7	P21826	554 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	OCA5	P38738	679 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	PUS2	P53167	370 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	REH1	Q06709	432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	PEX19	Q07418	342 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	ERG4	P25340	473 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CTF13	P35203	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	TAD1	P53065	400 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	ATP25	Q03153	612 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YLR040C	Q07988	224 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	SWM1	Q12379	170 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	TRM11	Q12463	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	SPC29	P33419	253 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	ASI2	P53895	289 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	RPN4	Q03465	531 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	YOR131C	Q12486	218 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PKR1	YMR123W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	MET7	Q08645	548 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	THI21	Q08975	551 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	PRC1	P00729	532 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.7	□□□□□ -1.82	not detected
PKR1	YMR123W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	YCL002C	P25565	263 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	SUL1	P38359	859 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	MET3	P08536	511 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	RAD53	P22216	821 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	NGG1	P32494	702 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PKR1	YMR123W	OAR1	P35731	278 aa		3.69	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.6 ms