RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W YHM2Q04013 314 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W STB3Q12427 513 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W ATP1P07251 545 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W MATALPHA2P0CY08 210 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HMLALPHA2P0CY09 210 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W SPO11P23179 398 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PEX34P25584 144 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PIH1P38768 344 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YKE2P52553 114 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W CUL3P53202 744 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W SFB2P53953 876 aa10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W ALG11P53954 548 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W TUF1P02992 437 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W IRA1P18963 3092 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W OPY1P38271 328 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W LEO1P38439 464 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W TAM41P53230 385 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ENV11P53246 860 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ARK1P53974 638 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W NSE5Q03718 556 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W NSE1Q07913 336 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W OSW2Q12202 724 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W OSH2Q12451 1283 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W CEX1Q12453 761 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SMC6Q12749 1114 aa10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W DBP5P20449 482 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W COT1P32798 439 aa10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ISM1P48526 1002 aa10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SPC98P53540 846 aa10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W HXK1P04806 485 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W CAF120P53836 1060 aa10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W TRS130Q03660 1102 aa10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W YML053CQ04978 212 aa10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W MSB2P32334 1306 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W OXP1P28273 1286 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SDA1P53313 767 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SLG1P54867 378 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W FUS2Q05670 677 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ADY4Q05955 493 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ECM7Q06200 448 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SHS1Q07657 551 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W PIN2Q12057 282 aa10.17□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W PRR1P28708 518 aa10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W VPH1P32563 840 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W PGM2P37012 569 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SIP3P38717 1229 aa10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W YGR153WP48238 217 aa10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W SDH5Q08230 162 aa10.16□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W TRL1P09880 827 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W FUS1P11710 512 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W MED6P38782 295 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W LSB6P42951 607 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ULI1P43604 169 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W ENT3P47160 408 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W YNR061CP53747 219 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W TIP41Q12199 356 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W APM4Q99186 491 aa10.15□□□□□ -0.78
YLR349WYLR349W TAF13P11747 167 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W DUG2P38149 878 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YBR284WP38150 797 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W SIP5P40210 489 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W ROG3P43602 733 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W ORC5P50874 479 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YGR130CP53278 816 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CBK1P53894 756 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W STP1Q00947 519 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W ADA2Q02336 434 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YLR407WQ06070 228 aa10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W GET3Q12154 354 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W HSP82P02829 709 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YEL076C-AP0CX16 216 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YLR464WP0CX17 216 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W FRS2P15625 503 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CBP3P21560 335 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W SIR1P21691 654 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data10.13□□□□□ -0.79not detected
YLR349WYLR349W RPC53P25441 422 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CYS3P31373 394 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W POL12P38121 705 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YEL076CP39971 216 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W ATH1P48016 1211 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W VTC3Q02725 835 aa10.13□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W HOM2P13663 365 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W PFK1P16861 987 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YOR296WQ08748 1289 aa10.12□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W MRM1P25270 412 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W MSH2P25847 964 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.1 ms