RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C VMA4P22203 233 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C NPL4P33755 580 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C BCH2P36122 765 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C NUP60P39705 539 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ALG2P43636 503 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data7.75□□□□□ -1.17not detected
YKR018CYKR018C CYB2P00175 591 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C CDC48P25694 835 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C RPC82P32349 654 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C CBF2P32504 956 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C HSM3P38348 480 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C STN1P38960 494 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SPR3P41901 512 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C CIT3P43635 486 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ZIP2P53061 704 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C RET3P53600 189 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C IST1P53843 298 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SNA3P14359 133 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C RFC3P38629 340 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ASE1P50275 885 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YLR462WO13556 202 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YEL076C-AP0CX16 216 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YLR464WP0CX17 216 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C GEF1P37020 779 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C TIF5P38431 405 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YHL049CP38722 271 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YEL076CP39971 216 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YEL075CP39972 122 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C PTP3P40048 928 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YER189WP40104 122 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SIP5P40210 489 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YFL064CP43540 174 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SHE10P53075 577 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C UBX4P54730 416 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C KRE28Q04431 385 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C GTB1Q04924 702 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C IOC2Q12072 812 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C TRM11Q12463 433 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YBL111CQ3E7Y5 667 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C FIG2P25653 1609 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ILV2P07342 687 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C PEP5P12868 1029 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SEC20P28791 383 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C MGM1P32266 881 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C NPL6P32832 435 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YKL050CP35736 922 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C BOI1P38041 980 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C PPS1P38148 807 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ALG5P40350 334 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C EMP47P43555 445 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C FMS1P50264 508 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C HAT1Q12341 374 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C FLO1P32768 1537 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data7.72□□□□□ -1.17 RIP-Chip
YKR018CYKR018C MST1P07236 462 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C SBP1P10080 294 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C NAT1P12945 854 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C TRK2P28584 889 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YBP1P38315 674 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C COS6P53344 381 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C CBK1P53894 756 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C NOP15P53927 220 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YMR018WQ04364 514 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C RGA2Q06407 1009 aa7.72□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ADE3P07245 946 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C CBF1P17106 351 aa7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C KES1P35844 434 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C DSE4P53753 1117 aa7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C UBP2Q01476 1272 aa7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
YKR018CYKR018C ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data7.71□□□□□ -1.18not detected
YKR018CYKR018C SLA2P33338 968 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C KTR2P33550 425 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C MMS21P38632 267 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C SSP1P38871 571 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C TEL2P53038 688 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C ALD6P54115 500 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C OSH6Q02201 448 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C RPM2Q02773 1202 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C SHR3Q02774 210 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C GRX1P25373 110 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C ADY2P25613 283 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C RPC19P28000 142 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C ATO2P32907 282 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C AST1P35183 429 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C BLI1P35727 113 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C YKL023WP36103 277 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C HIS2P38635 335 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C JEM1P40358 645 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C GPD2P41911 440 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C YRB1P41920 201 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YKR018CYKR018C SFB2P53953 876 aa7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.3 ms