RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	CEP3	P40969	608 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	NIT2	P47016	307 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	NCE103	P53615	221 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	SRT1	Q03175	343 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	CRR1	Q05790	422 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	YLL058W	Q12198	575 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	OSW2	Q12202	724 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YMR31	YFR049W	DIF1	O13577	133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SNF5	P18480	905 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	KCC4	P25389	1037 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YCL002C	P25565	263 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	FUN30	P31380	1131 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PTH2	P34222	208 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	CCZ1	P38273	704 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HSL7	P38274	827 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	BIT2	P38346	545 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	GIC1	P38785	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ACO2	P39533	789 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NPP2	P39997	493 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YFL052W	P43551	465 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RET2	P43621	546 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MTC3	P53077	123 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SLD3	P53135	668 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NPY1	P53164	384 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	EAR1	Q03212	550 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YHM2	Q04013	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NKP1	Q12493	238 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PRC1	P00729	532 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YHL012W	P38709	493 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	IES5	P40060	125 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	VID27	P40157	782 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HIS6	P40545	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	BFA1	P47113	574 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ALT1	P52893	592 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PUS2	P53167	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YNR014W	P53719	212 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
YMR31	YFR049W	ECM9	Q02202	377 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	VPS30	Q02948	557 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MLC2	Q06580	163 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	GAS5	Q08193	484 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SVS1	Q12254	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ACE2	P21192	770 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YKU70	P32807	602 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	KTR4	P38131	464 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PIK1	P39104	1066 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YKE2	P52553	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SDH1	Q00711	640 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SKY1	Q03656	742 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MIH1	P23748	554 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	TRK2	P28584	889 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RPD3	P32561	433 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YKR051W	P36142	418 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YHL041W	P38730	149 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	EMP65	P40085	556 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RRT14	P40470	206 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HXT16	P47185	567 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HFM1	P51979	1187 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SRC1	Q03707	834 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	COG4	Q06096	861 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PHO81	P17442	1178 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RSC6	P25632	483 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	APL1	P27351	700 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SEC65	P29478	273 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	DBF20	P32328	564 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SSH4	P32343	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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