RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W CDA1Q06702 301 aa4.15□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YLR040CQ07988 224 aa4.15□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SRP101P32916 621 aa4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SUL1P38359 859 aa4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ATF1P40353 525 aa4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YOL073CQ08232 322 aa4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W LAS17Q12446 633 aa4.14□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SPC110P32380 944 aa4.13□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SWE1P32944 819 aa4.13□□□□□ -1.75
VFA1YER128W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.13□□□□□ -1.75 RIP-Chip
VFA1YER128W MCH5Q08777 521 aa4.13□□□□□ -1.75
VFA1YER128W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
VFA1YER128W HSF1P10961 833 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W KAR4P25583 335 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ASF1P32447 279 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SLD2P34252 453 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W NCS6P53088 359 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W TMN2Q04562 672 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SPR28Q04921 423 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W BDF2Q07442 638 aa4.12□□□□□ -1.75
VFA1YER128W CLC1P17891 233 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W LYP1P32487 611 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ATG19P35193 415 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W KTR4P38131 464 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W URM1P40554 99 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W QRI1P43123 477 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W MDM38Q08179 573 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W GUP2Q08929 609 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YLL058WQ12198 575 aa4.11□□□□□ -1.75
VFA1YER128W TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W INO1P11986 533 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W MOT2P34909 587 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W MPP10P47083 593 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W POL32P47110 350 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W BUL1P48524 976 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W STB4P50104 949 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W TIM44Q01852 431 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SRT1Q03175 343 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W GRX3Q03835 250 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W OMS1Q06668 471 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W RKM4Q12504 494 aa4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VFA1YER128W HSC82P15108 705 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W FUN30P31380 1131 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data4.09□□□□□ -1.75not detected
VFA1YER128W VPS4P52917 437 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YMR206WQ03695 313 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W HRQ1Q05549 1077 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ACF2Q12168 779 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W YPL066WQ12194 479 aa4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VFA1YER128W ERG4P25340 473 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W YKL107WP34251 309 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W YKL151CP36059 337 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W CUE2P36075 443 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W BRN1P38170 754 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W FYV10P40492 516 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SNM1P40993 198 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W YGL176CP46945 554 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W NNF2P53253 936 aa4.08□□□□□ -1.76
VFA1YER128W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.08□□□□□ -1.76not detected
VFA1YER128W CDC11P32458 415 aa4.07□□□□□ -1.76
VFA1YER128W GIC1P38785 314 aa4.07□□□□□ -1.76
VFA1YER128W YJR107WP47145 328 aa4.07□□□□□ -1.76
VFA1YER128W TYW3P53177 273 aa4.07□□□□□ -1.76
VFA1YER128W IRC10Q08118 586 aa4.07□□□□□ -1.76
VFA1YER128W PET111P08468 800 aa4.06□□□□□ -1.76
VFA1YER128W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data4.06□□□□□ -1.76not detected
VFA1YER128W RNT1Q02555 471 aa4.06□□□□□ -1.76
VFA1YER128W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W ATE1P16639 503 aa4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W OSW7P43611 510 aa4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W TPO2P53283 614 aa4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VFA1YER128W DUT1P33317 147 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W PEA2P40091 420 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W HOS4P40480 1083 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W DOS2P54858 310 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W EEB1Q02891 456 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W UPC2Q12151 913 aa4.04□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SED4P25365 1065 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W RPC82P32349 654 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W LTV1P34078 463 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W MTH1P35198 433 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W MUK1Q02866 612 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SPO20Q04359 397 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W SGS1P35187 1447 aa4.03□□□□□ -1.76
VFA1YER128W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
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