RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MRPS18P42847 217 aa3.6□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C BUL1P48524 976 aa3.6□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C LAS17Q12446 633 aa3.6□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C SDS3P40505 327 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C THI12P42883 340 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C THI5P43534 340 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C DAS1P47005 663 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C THI11P47183 340 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C YGR122WP53272 402 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C THI13Q07748 340 aa3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
GCN4YEL009C YPK9Q12697 1472 aa3.59□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C BPT1P14772 1559 aa3.59□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C ALG7P07286 448 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C HSF1P10961 833 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MDM10P18409 493 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C PPZ2P33329 710 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C YAP1801P38856 637 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C STM1P39015 273 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C GNT1Q12096 491 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.58□□□□□ -1.84not detected
GCN4YEL009C SCC2Q04002 1493 aa3.58□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C SLA2P33338 968 aa3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C YHL017WP38745 532 aa3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MXR1P40029 184 aa3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C UFD4P33202 1483 aa3.56□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MUK1Q02866 612 aa3.56□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C RPO31P04051 1460 aa3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C RAD2P07276 1031 aa3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C DBP2P24783 546 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C IPL1P38991 367 aa3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C CDA1Q06702 301 aa3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C CDC43P18898 376 aa3.54□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C PNT1P38969 423 aa3.54□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MTC3P53077 123 aa3.54□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C MRL1Q06815 381 aa3.54□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C XYL2Q07993 356 aa3.54□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C CYC8P14922 966 aa3.53□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C YLL058WQ12198 575 aa3.53□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C POL1P13382 1468 aa3.53□□□□□ -1.84
GCN4YEL009C GCR1P07261 785 aa3.52□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C MCM7P38132 845 aa3.52□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C BNR1P40450 1375 aa3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RKR1Q04781 1562 aa3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SRP101P32916 621 aa3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RER2P35196 286 aa3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TDP1P38319 544 aa3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C STU1P38198 1513 aa3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SED4P25365 1065 aa3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SEC20P28791 383 aa3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C YIL166CP40445 542 aa3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SCS3P53012 380 aa3.5□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C CHD1P32657 1468 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C YOR1P53049 1477 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-FP0CX63 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-CP25384 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C MET3P08536 511 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C MCM2P29469 868 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C FUN30P31380 1131 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RPC82P32349 654 aa3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C CDC25P04821 1589 aa3.48□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C SMC4Q12267 1418 aa3.48□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RAD27P26793 382 aa3.48□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C YUR1P26725 428 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C DLT1Q04216 342 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C THI7Q05998 598 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C FRE5Q08908 694 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C RTT10Q08924 1013 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C UPC2Q12151 913 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C PAN1P32521 1480 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C MMS22Q06164 1454 aa3.47□□□□□ -1.85
GCN4YEL009C TAH11P47112 604 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ARO10Q06408 635 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C MDM38Q08179 573 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-BRQ12193 1756 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.8 ms