RNA–Protein interactions for RNA: YBL019W

APN2, Transcript of Class II abasic (AP) endonuclease involved in repair of DNA damage, yeast

Gene APN2, Length 1,563 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APN2	YBL019W	SRT1	Q03175	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	RSC58	Q07979	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	GSY1	P23337	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	SPC29	P33419	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	SAF1	P38352	637 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	YNL193W	P53870	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APN2	YBL019W	ACE2	P21192	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	FUN30	P31380	1131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	EMC3	P36039	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	PEX7	P39108	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	GYP8	P43570	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	ATP25	Q03153	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	VBA3	P25594	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	TOM20	P35180	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YER158C	P40095	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	RCM1	P53972	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	ENV7	Q12003	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	CDC9	P04819	755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
APN2	YBL019W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	RPC82	P32349	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YEL1	P34225	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MTC2	P34246	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	DSS1	P39112	969 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YEN1	P40028	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	HFM1	P51979	1187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	DAM1	P53267	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	TRE1	Q08919	783 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SRD1	P09007	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	PAF1	P38351	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MGS1	P40151	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	PMT3	P47190	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SFB2	P53953	876 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	RSB1	Q08417	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SVS1	Q12254	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	COQ2	P32378	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	CAF16	P43569	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	AVT1	P47082	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	HLJ1	P48353	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SDH1	Q00711	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	TRP3	P00937	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	PCL2	P25693	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YAP1801	P38856	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	COG8	Q04632	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	RSC3	Q06639	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MET7	Q08645	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	CHS2	P14180	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MRC1	P25588	1096 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	YKR073C	P36153	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	NIT3	P49954	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	GPG1	P53130	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	REH1	Q06709	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	THI73	Q07904	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	XYL2	Q07993	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	OSW2	Q12202	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APN2	YBL019W	MCD4	P36051	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	PTC7	P38797	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	YGR237C	P50089	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	UME1	Q03010	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	AIM26	P32858	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	RFC5	P38251	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
APN2	YBL019W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	NSI1	Q12457	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	NUP145	P49687	1317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	SPS1	P08458	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	SFL1	P20134	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	KAE1	P36132	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	GTS1	P40956	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	ATG36	P46983	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	HXT16	P47185	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	MET13	P53128	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	ENV11	P53246	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	SSY1	Q03770	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	ORC3	P54790	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	MSC2	Q03455	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APN2	YBL019W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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