RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	FLR1	P38124	548 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	RSM25	P40496	264 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	DJP1	P40564	432 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	SKP2	P42843	763 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	YJR107W	P47145	328 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	DIP5	P53388	608 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	ROD1	Q02805	837 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	ADY4	Q05955	493 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	SDH2	P21801	266 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	PET10	P36139	283 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	GPT2	P36148	743 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	HUL5	P53119	910 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	PGA2	P53903	129 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	SEC5	P89102	971 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	CUR1	Q06469	252 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	YOR131C	Q12486	218 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	GPA1	P08539	472 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	LDH1	P38139	375 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	SIP3	P38717	1229 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	YGL081W	P53156	320 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	FMP30	Q02883	468 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	MSC2	Q03455	724 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	COQ9	Q05779	260 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	YLH47	Q06493	454 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	PIB1	Q06651	286 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	APC11	Q12157	165 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CIN4	YMR138W	MAS2	P11914	482 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	AFT1	P22149	690 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	RPN12	P32496	274 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	UIP5	P36137	443 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YER130C	P39959	443 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	FYV10	P40492	516 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	ARK1	P53974	638 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	TCO89	Q08921	799 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YLL058W	Q12198	575 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	ATG11	Q12527	1178 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	NPR3	P38742	1146 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	PIH1	P38768	344 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	BCD1	P38772	366 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	HUL4	P40985	892 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	GUP1	P53154	560 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YDL057W	Q07379	328 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	SMC5	Q08204	1093 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	LDB19	Q12502	818 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	RTP1	Q12751	981 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	ECM29	P38737	1868 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	PCK1	P10963	549 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YFL040W	P43562	540 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	VID30	P53076	958 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	GPI13	Q07830	1017 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	CDC15	P27636	974 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	RAM2	P29703	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	IRE1	P32361	1115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	DPH2	P32461	534 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YSC83	P32792	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	COT1	P32798	439 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	MNN4	P36044	1178 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	JJJ3	P47138	172 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YPL034W	Q03083	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	GSY2	P27472	705 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	MSS51	P32335	436 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	DUR3	P33413	735 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	DID4	P36108	232 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	POA1	P38218	177 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	RRM3	P38766	723 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	AZR1	P50080	613 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	PSR2	Q07949	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	IES4	Q08561	116 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	YPL277C	Q08989	487 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	HFI1	Q12060	488 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	HIF1	Q12373	385 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	TRS33	Q99394	268 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CIN4	YMR138W	TAF13	P11747	167 aa		6.53	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms