RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	MXR1	P40029	184 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TOP3	P13099	656 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SNF5	P18480	905 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SRM1	P21827	482 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TSR4	P25040	408 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YRO2	P38079	344 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YBR284W	P38150	797 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PIK1	P39104	1066 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	LCD1	Q04377	747 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TDA6	Q06466	467 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	GSY1	P23337	708 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SFP1	P32432	683 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PEX6	P33760	1030 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	BAP2	P38084	609 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YHL012W	P38709	493 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MTC5	Q03897	1148 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	UGA2	P38067	497 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YFL066C	P43538	392 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MAL11	P53048	616 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NSG2	P53898	299 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MDL2	P33311	773 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MMM1	P41800	426 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	CIT3	P43635	486 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	ALG2	P43636	503 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TFB2	Q02939	513 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	THI72	Q08579	599 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MDM12	Q92328	271 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	AKR1	P39010	764 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	EAR1	Q03212	550 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YDR215C	Q12240	137 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YVC1	Q12324	675 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	ADR1	P07248	1323 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	GRX4	P32642	244 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	UBP12	P39538	1254 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TOK1	P40310	691 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RRT14	P40470	206 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	GYP7	P48365	746 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	DNM1	P54861	757 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	AFR1	P33304	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PRY1	P47032	299 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	ATG13	Q06628	738 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MDM38	Q08179	573 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PHM7	Q12252	991 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	BI4	P03879	638 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SAM35	P14693	329 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RAD53	P22216	821 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	FUN30	P31380	1131 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	COQ2	P32378	372 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	REC104	P33323	182 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YKL151C	P36059	337 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	DSS1	P39112	969 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YER158C	P40095	573 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YFL054C	P43549	646 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
TRZ1	YKR079C	RSB1	Q08417	382 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NSI1	Q12457	570 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MEF1	P25039	761 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NPP1	P25353	742 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RPC82	P32349	654 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	EMC3	P36039	253 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TAT1	P38085	619 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SAF1	P38352	637 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SPC29	P33419	253 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MDJ1	P35191	511 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NIT3	P49954	291 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	DAM1	P53267	343 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RCM1	P53972	490 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YMR187C	Q03236	431 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RSC58	Q07979	502 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.47	□□□□□ -1.85	not detected
TRZ1	YKR079C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	GIC1	P38785	314 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	HLJ1	P48353	224 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YPL062W	Q02781	134 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	SRT1	Q03175	343 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	NUP145	P49687	1317 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	YEL1	P34225	687 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TOM20	P35180	183 aa		3.46	□□□□□ -1.85

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