RNA–Protein interactions for RNA: YHR128W

FUR1, Transcript of Uracil phosphoribosyltransferase, yeast

Gene FUR1, Length 651 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FUR1	YHR128W	PMD1	P32634	1753 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	RNQ1	P25367	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	NFS1	P25374	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	PRD1	P25375	712 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	KCC4	P25389	1037 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YKL077W	P36081	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
FUR1	YHR128W	RMT2	Q03305	412 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	CTI6	Q08923	506 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	HSP78	P33416	811 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	ERT1	P38140	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	ECL1	P48235	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YNL050C	P53952	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	IOC4	Q04213	475 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	EXO5	P38289	585 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	SHU2	P38957	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	SLS1	P42900	643 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YCS4	Q06156	1176 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	THI22	Q06490	572 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YVC1	Q12324	675 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	CTT1	P06115	562 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	ADP1	P25371	1049 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	NNK1	P36003	928 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YHL050C	P38721	697 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YHR219W	P38900	624 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	YGL082W	P53155	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	ZDS2	P54786	942 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	SSY1	Q03770	852 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	TRE1	Q08919	783 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FUR1	YHR128W	COQ4	O13525	335 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YKL222C	P35995	705 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	UBP5	P39944	805 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	RTT109	Q07794	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	NEM1	P38757	446 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PEX7	P39108	375 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	SSP2	Q08646	371 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PRO1	P32264	428 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PFF1	P38244	976 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YAR028W	P39548	234 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	NIT1	P40447	199 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	RRT14	P40470	206 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	MDG1	P53885	366 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	NSE3	Q05541	303 aa		5	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	MSH3	P25336	1018 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PTC7	P38797	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	MAM1	P40065	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PEX13	P80667	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	TPP1	Q03796	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	LYS2	P07702	1392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	HKR1	P41809	1802 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	UGA4	P32837	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	RSM26	P47141	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	GYP7	P48365	746 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	DAL4	Q04895	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	BDF2	Q07442	638 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	VPS35	P34110	944 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	ATG14	P38270	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	GTS1	P40956	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	ORC3	P54790	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	UBP16	Q02863	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	ERO1	Q03103	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	VPS64	Q03944	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUR1	YHR128W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	SLD2	P34252	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	SQT1	P35184	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	ULP1	Q02724	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	SRT1	Q03175	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	FCP1	Q03254	732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	CDA2	Q06703	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUR1	YHR128W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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