RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ECM5Q03214 1411 aa6.09□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W ATG2P53855 1592 aa6.09□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SNF5P18480 905 aa6.09□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W GAL11P19659 1081 aa6.09□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.09□□□□□ -1.43not detected
PRD1YCL057W DNA2P38859 1522 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.08□□□□□ -1.44not detected
PRD1YCL057W YVC1Q12324 675 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YOR1P53049 1477 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SAM35P14693 329 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SLA2P33338 968 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W GEM1P39722 662 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W ICP55P40051 511 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W MMM1P41800 426 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W BUD4P47136 1447 aa6.08□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W NUP170P38181 1502 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W TAT1P38085 619 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SAF1P38352 637 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W AKR1P39010 764 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SIT1P39980 628 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W HUL4P40985 892 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W RTA1P53047 317 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W TNA1P53322 534 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W ACM1Q08981 209 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YLR125WQ12138 136 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W MYO4P32492 1471 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W ERR1P0CX10 437 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W ERR2P0CX11 437 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W PHO8P11491 566 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W BET3P36149 193 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YFL054CP43549 646 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.07□□□□□ -1.44not detected
PRD1YCL057W HBN1Q96VH4 193 aa6.07□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W ENP1P38333 483 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W CIT3P43635 486 aa6.06□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YKL151CP36059 337 aa6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YDR306CQ06640 478 aa6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W MCA1Q08601 432 aa6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W STH1P32597 1359 aa6.05□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W MET6P05694 767 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W CDC12P32468 407 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W CCC2P38995 1004 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W CDC11P32458 415 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W UGA2P38067 497 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YHL012WP38709 493 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W PIK1P39104 1066 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YPL034WQ03083 165 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W HRQ1Q05549 1077 aa6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W MLP2P40457 1679 aa6.03□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W COQ4O13525 335 aa6.03□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W TPO2P53283 614 aa6.03□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W SPT7P35177 1332 aa6.03□□□□□ -1.44
PRD1YCL057W TOP3P13099 656 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W AFR1P33304 620 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MDL2P33311 773 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W FPR3P38911 411 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PEX7P39108 375 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W RCM1P53972 490 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YLL058WQ12198 575 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PRO1P32264 428 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MTC3P53077 123 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YLR122CQ12312 125 aa6.02□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W SCT1P32784 759 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W CCZ1P38273 704 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MAL11P53048 616 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W ATG13Q06628 738 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W BI4P03879 638 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W THS1P04801 734 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W CHS2P14180 963 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W THI4P32318 326 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PET10P36139 283 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W RSC58Q07979 502 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PAN1P32521 1480 aa6.01□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W COQ2P32378 372 aa6□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YBR284WP38150 797 aa6□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W UBP6P43593 499 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TRE1Q08919 783 aa6□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MSD1P15179 658 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MSH2P25847 964 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PPH3P32345 308 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MNN1P39106 762 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W POB3Q04636 552 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W SMC4Q12267 1418 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W ADE8P04161 214 aa5.99□□□□□ -1.45
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