RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PRX1	YBL064C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PRX1	YBL064C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PRX1	YBL064C	SPO21	Q12411	609 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PRX1	YBL064C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PRX1	YBL064C	NUP145	P49687	1317 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	KIP1	P28742	1111 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ALG2	P43636	503 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	UME1	Q03010	460 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	THI73	Q07904	523 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	TMA17	Q12513	150 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	YRO2	P38079	344 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ALG14	P38242	237 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	LCD1	Q04377	747 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SGS1	P35187	1447 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ADE8	P04161	214 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
PRX1	YBL064C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	VBA3	P25594	458 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SWE1	P32944	819 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	GPB2	P39717	880 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	MXR1	P40029	184 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	GPG1	P53130	126 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	CDC9	P04819	755 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	AFR1	P33304	620 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SPC29	P33419	253 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ERT1	P38140	529 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	MGS1	P40151	587 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	TOK1	P40310	691 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	YJR120W	P47157	116 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	PEX8	P53248	589 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	VPS72	Q03388	795 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SEC6	P32844	805 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	NNK1	P36003	928 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	DSE4	P53753	1117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	ACM1	Q08981	209 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRX1	YBL064C	SRD1	P09007	221 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	RAD18	P10862	487 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	NPP1	P25353	742 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	PRO1	P32264	428 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	REC104	P33323	182 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	SLA2	P33338	968 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YEL1	P34225	687 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	BAP2	P38084	609 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YJL045W	P47052	634 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	NHA1	Q99271	985 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YKL151C	P36059	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	SKN7	P38889	622 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	NIT1	P40447	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	GYP8	P43570	497 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	MET13	P53128	600 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	PCL2	P25693	308 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	MTC2	P34246	357 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	GPT2	P36148	743 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	HFD1	Q04458	532 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	SFL1	P20134	766 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	EUG1	P32474	517 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	EMC3	P36039	253 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	UGA2	P38067	497 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YBR071W	P38243	211 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	YFL054C	P43549	646 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRX1	YBL064C	TY4A-J	P47023	414 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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