RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000223922.1

Rab3c-202, Transcript of Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

BASIC

Gene Rab3c, Length 2,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3c-202ENSMUST00000223922 PappaQ8R4K8 1624 aa14.82□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 AppP12023 770 aa14.82□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ppme1Q8BVQ5 386 aa14.82□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Pdzd9Q9D9M4 266 aa14.82□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa14.82□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.81□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 GakQ99KY4 1305 aa14.81□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm10354K7N6A0 256 aa14.81□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Uspl1Q3ULM6 1089 aa14.81□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm7361D3Z6R1 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm1979E9QAN3 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm5862K7N5V5 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm10220K7N660 267 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Abcc12Q80WJ6 1366 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ppfibp2O35711 882 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Asic4Q7TNS7 539 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Lrit1Q8K099 624 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Swt1Q9DBQ9 907 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ccdc6D3YZP9 469 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Usp19Q3UJD6 1360 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Snrnp27Q8K194 155 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Rgs17Q9QZB0 210 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gm17615E9Q9P2 165 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 GalcP54818 684 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 ApobrQ8VBT6 942 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Stk3Q9JI10 497 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Map7d2A2AG50 781 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 UncxO08934 530 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Tspan18Q80WR1 248 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Sos1Q62245 1319 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Trim66Q924W6 1242 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Myo5bP21271 1818 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Stk10O55098 966 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Sos2Q02384 1333 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Arhgap33Q80YF9 1305 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gabpb2P81069 414 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Jade2Q6ZQF7 829 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Crb1Q8VHS2 1405 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ccdc173A0JLY1 547 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Bsdc1Q80Y55 427 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Tulp1Q9Z273 543 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Vars2Q3U2A8 1060 aa14.74□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Pnpla7A2AJ88 1352 aa14.73□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ctage5Q8R311 779 aa14.73□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 StimateQ3UF25 288 aa14.72□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Atl2Q6PA06 583 aa14.72□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Scp2P32020 547 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ralbp1Q62172 648 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Abca3Q8R420 1704 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Snap23O09044 210 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Clec4gQ8BNX1 294 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ints5Q8CHT3 1018 aa14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Apba2P98084 750 aa14.7□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Klc3Q91W40 508 aa14.7□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 FosbP13346 338 aa14.7□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Znf622Q91VY9 476 aa14.7□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Frmd4bQ920B0 1035 aa14.69□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Jmjd4Q8BFT6 427 aa14.69□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa14.69□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 CrbnQ8C7D2 445 aa14.68□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Shank3Q4ACU6 1730 aa14.68□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Nkx2-3P97334 362 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Btbd11Q6GQW0 1109 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ccdc155Q80VJ8 648 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Zbtb12Q9Z150 459 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gnai1B2RSH2 354 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Gnai3Q9DC51 354 aa14.67□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Pim2Q62070 370 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Cep120Q7TSG1 988 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Snapc4Q8BP86 1333 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ccdc38Q8CDN8 563 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Otud6bQ8K2H2 294 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 OscarQ8VBT3 265 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Erbb3Q61526 1339 aa14.66□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Atg3Q9CPX6 314 aa14.65□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 AceP09470 1312 aa14.65□□□□□ -0.06
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Ankrd13dQ6PD24 605 aa14.65□□□□□ -0.07
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa14.64□□□□□ -0.07
Rab3c-202ENSMUST00000223922 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms