Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.22■■■■■ 5.79
Rps6ka4Q9Z2B9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Rps6ka4Q9Z2B9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rps6ka4Q9Z2B9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rps6ka4Q9Z2B9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rps6ka4Q9Z2B9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rps6ka4Q9Z2B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Rps6ka4Q9Z2B9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rps6ka4Q9Z2B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rps6ka4Q9Z2B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms