Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNX1

Clec4g, C-type lectin domain family 4 member G, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4gQ8BNX1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Clec4gQ8BNX1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clec4gQ8BNX1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clec4gQ8BNX1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clec4gQ8BNX1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Clec4gQ8BNX1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Clec4gQ8BNX1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Clec4gQ8BNX1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clec4gQ8BNX1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Clec4gQ8BNX1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Clec4gQ8BNX1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clec4gQ8BNX1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Clec4gQ8BNX1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clec4gQ8BNX1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clec4gQ8BNX1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clec4gQ8BNX1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Clec4gQ8BNX1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clec4gQ8BNX1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clec4gQ8BNX1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clec4gQ8BNX1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clec4gQ8BNX1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clec4gQ8BNX1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clec4gQ8BNX1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clec4gQ8BNX1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Clec4gQ8BNX1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clec4gQ8BNX1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Clec4gQ8BNX1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clec4gQ8BNX1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clec4gQ8BNX1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clec4gQ8BNX1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clec4gQ8BNX1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clec4gQ8BNX1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clec4gQ8BNX1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clec4gQ8BNX1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clec4gQ8BNX1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clec4gQ8BNX1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clec4gQ8BNX1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Clec4gQ8BNX1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clec4gQ8BNX1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clec4gQ8BNX1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clec4gQ8BNX1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clec4gQ8BNX1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clec4gQ8BNX1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clec4gQ8BNX1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clec4gQ8BNX1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Clec4gQ8BNX1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clec4gQ8BNX1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec4gQ8BNX1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec4gQ8BNX1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clec4gQ8BNX1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clec4gQ8BNX1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clec4gQ8BNX1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec4gQ8BNX1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Clec4gQ8BNX1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clec4gQ8BNX1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clec4gQ8BNX1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clec4gQ8BNX1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clec4gQ8BNX1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clec4gQ8BNX1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clec4gQ8BNX1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clec4gQ8BNX1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clec4gQ8BNX1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clec4gQ8BNX1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec4gQ8BNX1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec4gQ8BNX1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clec4gQ8BNX1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clec4gQ8BNX1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clec4gQ8BNX1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clec4gQ8BNX1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec4gQ8BNX1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clec4gQ8BNX1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clec4gQ8BNX1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clec4gQ8BNX1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clec4gQ8BNX1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clec4gQ8BNX1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clec4gQ8BNX1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec4gQ8BNX1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec4gQ8BNX1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec4gQ8BNX1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clec4gQ8BNX1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec4gQ8BNX1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clec4gQ8BNX1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clec4gQ8BNX1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clec4gQ8BNX1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clec4gQ8BNX1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec4gQ8BNX1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clec4gQ8BNX1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec4gQ8BNX1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clec4gQ8BNX1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clec4gQ8BNX1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clec4gQ8BNX1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clec4gQ8BNX1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clec4gQ8BNX1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Clec4gQ8BNX1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec4gQ8BNX1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clec4gQ8BNX1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec4gQ8BNX1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clec4gQ8BNX1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clec4gQ8BNX1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clec4gQ8BNX1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms