Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
Gtpbp6Q3U6U5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Gtpbp6Q3U6U5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Gtpbp6Q3U6U5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Gtpbp6Q3U6U5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Gtpbp6Q3U6U5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Gtpbp6Q3U6U5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Gtpbp6Q3U6U5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Gtpbp6Q3U6U5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Gtpbp6Q3U6U5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Gtpbp6Q3U6U5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Gtpbp6Q3U6U5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Gtpbp6Q3U6U5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Gtpbp6Q3U6U5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gtpbp6Q3U6U5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gtpbp6Q3U6U5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Gtpbp6Q3U6U5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gtpbp6Q3U6U5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gtpbp6Q3U6U5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Gtpbp6Q3U6U5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Gtpbp6Q3U6U5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gtpbp6Q3U6U5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gtpbp6Q3U6U5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Gtpbp6Q3U6U5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gtpbp6Q3U6U5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Gtpbp6Q3U6U5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gtpbp6Q3U6U5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gtpbp6Q3U6U5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gtpbp6Q3U6U5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
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