Protein–RNA interactions for Protein: O08934

Uncx, Homeobox protein unc-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UncxO08934 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
UncxO08934 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
UncxO08934 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
UncxO08934 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
UncxO08934 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
UncxO08934 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
UncxO08934 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
UncxO08934 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
UncxO08934 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
UncxO08934 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
UncxO08934 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
UncxO08934 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
UncxO08934 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
UncxO08934 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
UncxO08934 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
UncxO08934 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
UncxO08934 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
UncxO08934 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
UncxO08934 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
UncxO08934 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
UncxO08934 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
UncxO08934 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
UncxO08934 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
UncxO08934 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
UncxO08934 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
UncxO08934 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
UncxO08934 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
UncxO08934 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
UncxO08934 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
UncxO08934 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UncxO08934 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UncxO08934 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
UncxO08934 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
UncxO08934 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
UncxO08934 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
UncxO08934 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
UncxO08934 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
UncxO08934 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
UncxO08934 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
UncxO08934 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
UncxO08934 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
UncxO08934 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
UncxO08934 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
UncxO08934 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
UncxO08934 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
UncxO08934 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
UncxO08934 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
UncxO08934 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
UncxO08934 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
UncxO08934 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
UncxO08934 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
UncxO08934 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
UncxO08934 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
UncxO08934 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
UncxO08934 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UncxO08934 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UncxO08934 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UncxO08934 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UncxO08934 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
UncxO08934 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
UncxO08934 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
UncxO08934 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
UncxO08934 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
UncxO08934 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
UncxO08934 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
UncxO08934 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
UncxO08934 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
UncxO08934 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
UncxO08934 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
UncxO08934 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
UncxO08934 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
UncxO08934 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
UncxO08934 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
UncxO08934 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
UncxO08934 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
UncxO08934 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
UncxO08934 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
UncxO08934 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
UncxO08934 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
UncxO08934 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UncxO08934 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UncxO08934 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UncxO08934 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UncxO08934 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
UncxO08934 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
UncxO08934 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UncxO08934 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UncxO08934 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UncxO08934 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UncxO08934 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UncxO08934 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
UncxO08934 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UncxO08934 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UncxO08934 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UncxO08934 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UncxO08934 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
UncxO08934 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UncxO08934 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
UncxO08934 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UncxO08934 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms