Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.94■■■■■ 5.91
Ppfibp2O35711 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Ppfibp2O35711 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Ppfibp2O35711 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
Ppfibp2O35711 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Ppfibp2O35711 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ppfibp2O35711 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ppfibp2O35711 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Ppfibp2O35711 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Ppfibp2O35711 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ppfibp2O35711 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Ppfibp2O35711 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Ppfibp2O35711 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ppfibp2O35711 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ppfibp2O35711 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Ppfibp2O35711 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ppfibp2O35711 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ppfibp2O35711 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ppfibp2O35711 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ppfibp2O35711 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ppfibp2O35711 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Ppfibp2O35711 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Ppfibp2O35711 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ppfibp2O35711 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ppfibp2O35711 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ppfibp2O35711 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ppfibp2O35711 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ppfibp2O35711 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Ppfibp2O35711 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ppfibp2O35711 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ppfibp2O35711 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Ppfibp2O35711 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ppfibp2O35711 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ppfibp2O35711 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Ppfibp2O35711 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ppfibp2O35711 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ppfibp2O35711 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ppfibp2O35711 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ppfibp2O35711 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ppfibp2O35711 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ppfibp2O35711 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Ppfibp2O35711 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ppfibp2O35711 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.13■■■■□ 3.86
Ppfibp2O35711 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Ppfibp2O35711 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ppfibp2O35711 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Ppfibp2O35711 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Ppfibp2O35711 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ppfibp2O35711 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Ppfibp2O35711 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ppfibp2O35711 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Ppfibp2O35711 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ppfibp2O35711 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ppfibp2O35711 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ppfibp2O35711 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ppfibp2O35711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ppfibp2O35711 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ppfibp2O35711 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ppfibp2O35711 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ppfibp2O35711 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ppfibp2O35711 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ppfibp2O35711 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ppfibp2O35711 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ppfibp2O35711 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Ppfibp2O35711 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ppfibp2O35711 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ppfibp2O35711 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ppfibp2O35711 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ppfibp2O35711 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ppfibp2O35711 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ppfibp2O35711 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ppfibp2O35711 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ppfibp2O35711 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ppfibp2O35711 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ppfibp2O35711 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ppfibp2O35711 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ppfibp2O35711 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Ppfibp2O35711 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ppfibp2O35711 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ppfibp2O35711 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ppfibp2O35711 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Ppfibp2O35711 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ppfibp2O35711 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Ppfibp2O35711 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ppfibp2O35711 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ppfibp2O35711 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ppfibp2O35711 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ppfibp2O35711 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ppfibp2O35711 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ppfibp2O35711 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ppfibp2O35711 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ppfibp2O35711 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ppfibp2O35711 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ppfibp2O35711 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ppfibp2O35711 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ppfibp2O35711 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ppfibp2O35711 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ppfibp2O35711 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms