Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Frmd4bQ920B0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmd4bQ920B0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmd4bQ920B0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Frmd4bQ920B0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmd4bQ920B0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Frmd4bQ920B0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Frmd4bQ920B0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmd4bQ920B0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmd4bQ920B0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmd4bQ920B0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmd4bQ920B0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frmd4bQ920B0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmd4bQ920B0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmd4bQ920B0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmd4bQ920B0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmd4bQ920B0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmd4bQ920B0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmd4bQ920B0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmd4bQ920B0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmd4bQ920B0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmd4bQ920B0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmd4bQ920B0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmd4bQ920B0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmd4bQ920B0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmd4bQ920B0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmd4bQ920B0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmd4bQ920B0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmd4bQ920B0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmd4bQ920B0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmd4bQ920B0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd4bQ920B0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd4bQ920B0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmd4bQ920B0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd4bQ920B0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd4bQ920B0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd4bQ920B0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmd4bQ920B0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmd4bQ920B0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmd4bQ920B0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmd4bQ920B0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmd4bQ920B0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmd4bQ920B0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmd4bQ920B0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmd4bQ920B0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmd4bQ920B0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmd4bQ920B0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmd4bQ920B0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd4bQ920B0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmd4bQ920B0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmd4bQ920B0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd4bQ920B0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmd4bQ920B0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmd4bQ920B0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmd4bQ920B0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmd4bQ920B0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmd4bQ920B0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmd4bQ920B0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmd4bQ920B0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmd4bQ920B0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmd4bQ920B0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmd4bQ920B0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmd4bQ920B0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmd4bQ920B0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmd4bQ920B0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmd4bQ920B0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmd4bQ920B0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmd4bQ920B0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd4bQ920B0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Frmd4bQ920B0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmd4bQ920B0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmd4bQ920B0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmd4bQ920B0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmd4bQ920B0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd4bQ920B0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmd4bQ920B0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd4bQ920B0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd4bQ920B0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd4bQ920B0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd4bQ920B0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmd4bQ920B0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd4bQ920B0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd4bQ920B0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd4bQ920B0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd4bQ920B0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd4bQ920B0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd4bQ920B0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmd4bQ920B0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd4bQ920B0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd4bQ920B0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmd4bQ920B0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmd4bQ920B0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmd4bQ920B0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmd4bQ920B0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmd4bQ920B0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd4bQ920B0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmd4bQ920B0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms