RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa15.48■□□□□ 0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col4a1P02463 1669 aa15.48■□□□□ 0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wwc1Q5SXA9 1104 aa15.48■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg4aQ8C9S8 396 aa15.47■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa15.47■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa15.46■□□□□ 0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nphp1Q9QY53 687 aa15.46■□□□□ 0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NmiO35309 314 aa15.43■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ier5O89113 308 aa15.43■□□□□ 0.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk36Q69ZM6 1316 aa15.43■□□□□ 0.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EngaseQ8BX80 734 aa15.41■□□□□ 0.06
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