RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	RRI2	Q12348	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RTP1	Q12751	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CHS2	P14180	963 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CMP2	P14747	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	VAN1	P23642	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	AAD3	P25612	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PEX6	P33760	1030 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SEA4	P38164	1038 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CAJ1	P39101	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	AIM20	P40451	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ACF4	P47129	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SRB7	P47822	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YGR016W	P53209	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SPC19	Q03954	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PSR1	Q07800	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YRM1	Q12340	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	WHI5	Q12416	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ACE2	P21192	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YKL222C	P35995	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PAF1	P38351	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MDM38	Q08179	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MNL2	Q12205	849 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	CYC7	P00045	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MEF1	P25039	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SSH4	P32343	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SPC110	P32380	944 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	RRN3	P36070	627 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	GIP1	P38229	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YBR197C	P38306	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MAM1	P40065	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	NDE1	P40215	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	NUP82	P40368	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	HOL1	P53389	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	ECM23	Q02710	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	AOS1	Q06624	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	BDF2	Q07442	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	APN1	P22936	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	HIR1	P32479	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	NIP100	P33420	868 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	TGL4	P36165	910 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	ESL2	P36168	1195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	IES5	P40060	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SAP185	P40856	1058 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	VTC2	P43585	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YJR107W	P47145	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PPT1	P53043	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	VID30	P53076	958 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	TAP42	Q04372	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	ATP4	P05626	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	CLN2	P20438	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	RNQ1	P25367	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	IME2	P32581	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	ELM1	P32801	640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YKL100C	P34248	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YKL050C	P35736	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	RPC37	P36121	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	DYS1	P38791	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	POP2	P39008	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YIL165C	P40446	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SPO74	P45819	413 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	NNF2	P53253	936 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	DSE4	P53753	1117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	VPS16	Q03308	798 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SND1	Q04007	877 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PIN2	Q12057	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PHO8	P11491	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MER1	P16523	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MSH2	P25847	964 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PXA2	P34230	853 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	SAP190	P36123	1033 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	TFA2	P36145	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	PAN5	P38787	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	NIT1	P40447	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	MDJ2	P42834	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	GYP7	P48365	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	CWH41	P53008	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPT53	YNL093W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms