RNA–Protein interactions for RNA: YMR112C

MED11, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED11, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED11	YMR112C	UBP12	P39538	1254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	YGL176C	P46945	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	VPS53	P47061	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	TPO2	P53283	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	UGO1	Q03327	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	AI1	P03875	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	BET3	P36149	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	HSE1	P38753	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	YAR028W	P39548	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	MBP1	P39678	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
MED11	YMR112C	NSG2	P53898	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MED11	YMR112C	NTG2	Q08214	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	LAP2	Q10740	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SAC7	P17121	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SRM1	P21827	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	GIP2	P40036	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SPO74	P45819	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	ELG1	Q12050	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	CDC11	P32458	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	CCC2	P38995	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	MAL11	P53048	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
MED11	YMR112C	GIC2	Q06648	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	PTC5	Q12511	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	TOP1	P04786	769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	MLS1	P30952	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	GDH3	P39708	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SIT1	P39980	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	TED1	P40533	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	PAF1	P38351	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	PNT1	P38969	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	GEM1	P39722	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	ATG36	P46983	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	DNM1	P54861	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED11	YMR112C	SFP1	P32432	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	PEX6	P33760	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	PET10	P36139	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ALG14	P38242	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YJR008W	P47085	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YGR045C	P53229	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YNR063W	P53749	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	THI72	Q08579	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MDM12	Q92328	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ADR1	P07248	1323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ERS1	P17261	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MRC1	P25588	1096 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YEN1	P40028	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YFL066C	P43538	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RTS3	P53289	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	DSE4	P53753	1117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	TFB2	Q02939	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NHA1	Q99271	985 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YER152C	P10356	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NNK1	P36003	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	SPO21	Q12411	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	TOP3	P13099	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	GSY1	P23337	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NFS1	P25374	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	KIP1	P28742	1111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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