RNA–Protein interactions for RNA: YAL003W

EFB1, Transcript of Translation elongation factor 1 beta, yeast

Gene EFB1, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFB1	YAL003W	PCL8	Q08966	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MCM16	Q12262	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PEP3	P27801	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	TBS1	P38114	1094 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	OPY1	P38271	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MTC3	P53077	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	FLO11	P08640	1367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	FLO1	P32768	1537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RER2	P35196	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SLX8	P40072	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	FET4	P40988	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	LSB6	P42951	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SRS2	P12954	1174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PCT1	P13259	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	IMP2'	P32351	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SIS2	P36024	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	STV1	P37296	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MRPL16	P38064	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	VPS4	P52917	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	EST2	Q06163	884 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RLF2	Q12495	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RAD61	Q99359	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CBP1	P07252	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	KIN1	P13185	1064 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RAD53	P22216	821 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PRE8	P23639	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ANP1	P32629	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MYO3	P36006	1272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YHL050C	P38721	697 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PES4	P39684	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	NIT1	P40447	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	UFD2	P54860	961 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ECM23	Q02710	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SRM1	P21827	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ADP1	P25371	1049 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PEA2	P40091	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	VID27	P40157	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	VID28	P40547	921 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YKE2	P52553	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ARP5	P53946	755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	STB3	Q12427	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	GAL2	P13181	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MAK31	P23059	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RIT1	P23796	513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TTI1	P36097	1038 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YBL028C	P38202	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YHL017W	P38745	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	VPS8	P39702	1274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SPR3	P41901	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ALG2	P43636	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PRY1	P47032	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	VPS20	Q04272	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TFC6	Q06339	672 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	IME2	P32581	645 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TAT1	P38085	619 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MAL31	P38156	614 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CST26	P38226	397 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	HDA1	P53973	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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