Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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