Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KRW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KRW8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KRW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KRW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KRW8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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