Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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