Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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