Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms